La Farnesina è stata oggetto di attacchi hacker per almeno 16 mesi, fin dalla primavera del 2014. E' l'opinione degli inquirenti del Cnaipic, il Centro nazionale anticrimine informatico della polizia postale, che indagano sulla vicenda di cyber spionaggio ai danni dell'Italia. Il ministero degli Affari esteri sarebbe stato dunque spiato fin dai tempi in cui titolare del dicastero era Federica Mogherini.
Il fascicolo aperto dalla procura sull'attività di cyber spionaggio ai danni della Farnesina è tuttora contro ignoti per i reati di procacciamento di notizie concernenti la sicurezza dello Stato, accesso abusivo a sistema informatico aggravato, intercettazione illecita di comunicazioni informatiche, e spionaggio politico e militare.