La Gdf di Bergamo, oltre che negli uffici del ministero della Salute all'Eur e Lungotevere, ha eseguito perquisizioni anche all'Istituto Superiore della Sanità a Roma. I militari, come si evince dall'ordine di esibizione firmato dai pm bergamaschi, si sono fatti consegnare la documentazione cartacea ed elettronica relativa al piano pandemico nazionale del 2017, che si ritiene sia il copia-incolla di quello del 2006.
Le Fiamme Gialle inoltre si trovano nelle sedi della Ats di Bergamo e dalla Asst di Bergamo est e in Regione Lombardia. Le indagini riguardano anche il piano pandemico regionale.