E' stato un percorso lungo 18 anni, quello verso l'elevazione agli altari del frate di Pietrelcina: il processo di canonizzazione è infatti iniziato il 23 marzo 1983 a san Giovanni Rotondo.
Il 18 dicembre 1997 Giovanni Paolo II lo aveva proclamato venerabile in seguito al riconoscimento della "eroicità delle virtu"'. E sempre il Papa lo ha proclamato beato il 2 maggio 1999. Subito dopo la beatificazione sono state avviate le pratiche per farlo diventare santo, e per questo è stato necessario il riconoscimento di un miracolo da attribuire alla sua intercessione.
Per padre Pio c'è stato quasi l'imbarazzo della scelta: dopo molte indecisioni, alla fine il postulatore ha scelto quello riguardante la guarigione del piccolo Matteo Pio Colella, la cui guarigione inspiegabile è stata riconosciuta il 22 novembre dalla commissione medica. L'ultimo passo, ora, spetta al Pontefice, che dopo la firma dell'atto fisserà il giorno della canonizzazione.